羊糞與秸稈、鋸末屑、蘑菇渣、干泥土粉等按適當比例混合。1噸物料(鮮料約2.5噸)加1公斤微生物有機肥菌種，按0.5公斤有微生物機肥菌種加5公斤米糠（或麩皮、玉米粉等替代物）稀釋后再均勻撒入物料堆，混拌發酵。在做堆時請不要做的太小，太小會影響發酵，高度在1.5米左右，寬度2米，長度在2米以上的堆發酵效果比較好。發酵過程注意適當供氧與翻堆（溫度升至75℃或以上時要翻倒幾次），升溫控制在65℃左右，溫度太高對養分有影響。發酵物料的水分應控制在60～65%。調整物料水分方法：水分過高可添加秸稈、鋸末屑、蘑菇渣、干泥土粉等。水分合適與否判斷辦法：手緊抓一把物料，指縫見水印但不滴水，落地即散。整個發酵過程5～7天完成。成品有機肥為蓬松狀、呈黑褐色，略帶酒香味或泥土味，營養豐富，用于瓜果蔬菜、經濟作物、苗木花卉營養土，增值數倍。
羊糞有機肥料中的微生物在土壤中的繁殖速度非常快，他們就像一張看不見的大網，錯綜復雜。微生物的菌體后，在土壤中留下了很多微細的管道，這些微細的管道不但增加了土壤的透氣性，而且還使土壤變得蓬松柔軟，養分水分不易流失，增加了土壤蓄水蓄肥能力，避免和消除了土壤的板結。
羊糞有機肥料分解釋放的CO2可作為植物光合作用的材料。羊糞有機肥料還含有氮、磷、鉀6-8%三要素，有機質50-55%，可為農作物提供全面的營養。
羊糞有機肥料中的有益微生物利用土壤中的有機質，產生次級代謝物，其中含有大量的促生長類物質。如生長素，能促進植物伸長生長，脫落酸能促進果實成熟，赤能促進開花坐果，增加開花數、保果率，提高產量，使果實飽滿，色澤鮮嫩，還能提早上市，達到增產增收。
化肥的實際利用率只有30%～45%。損失的化肥一部分分解釋放到大氣中，一部分則隨著水土流失掉了，還有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收利用。
當施入羊糞有機肥料后，由于有益生物活動改善了土壤結構，增加了土壤保水保肥能力，從而減少了養分的流失。加上有益微生物解磷解鉀作用，能使化肥有效利用率提高到50%以上。
羊糞是一種較為常用的有機肥料，它含有大量的有機質及養分，如氮、磷、鉀等，同時還有一定的腐殖質，具有很好的改良土壤的效果。使用羊糞有機肥可以有效改善土壤的質量，增加土壤的有機質，提高土壤的水分釋放性，促進植物的生長發育。
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