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雖然有機肥的成分種類較多，但是每種養分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學肥料配合使用，效果更好。
隨著科學技術的不斷發展，通過有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養技術，將有益菌群接入無害化處理后有機肥中，可以生產出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質、減少環境污染、增肥增效等。
有機農業中使用的有機肥需經過有機認證機構的認證，符合產品的生產標準。近些年來，我國各種生物肥料發展迅速，年產量達數十萬噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產效果明顯和為主要特點，它的生產、推廣和應用對增進土壤肥力，提高農作物產量，改善農作物品質和切實推行農業可持續發展都有積極意義。 針對生物肥料在生產、產品質量和使用等方面存在的問題，本刊記者采訪了江西農業大學高勇生教授，旨在提高農村廣大群眾對這類肥料的認識，更加正確、科學地使用這些肥料，以促進我國生物肥料的健康發展。

看有機肥料外觀顏色，物理方法干燥的有機肥料，仍保持原糞便的顏色，只是水分減少，通過堆肥技術處理的有機肥料腐熟后顏色變為褐色或黑褐色，在成品中沒有其它雜質。 二摸：用手抓一把有機肥料，其手感一致，濕時柔軟有彈性，干時很脆，容易破碎，劣質有機肥料用手可以摸到雜質，特別是沙子。 三水泡：拿兩杯清水，分別放入一些和低劣有機肥料，幾分鐘就可分辨出真偽。有機肥料摻假一般是加入沙子或土來增加重量。有機肥料在水中分布均勻，而劣質有機肥料的杯底沉入很多沙子或土，區別明顯。

生物有機肥巧鑒別 一看包裝，是否規范。包括產品登記證、產品技術指標、產品有效期； 二看物料，是否均勻。產品含水量太高或太低均不利于菌種存活，判斷方法：抓一把肥料在陽光下觀察，陰潮呈團、干燥呈灰都非正常產品。 三看效果，是否。試驗方法：加少量水將生物有機肥調成團狀，放在冰箱里凍成冰塊，第二天拿出來融化，反復三次，肥料中的菌種將會凍死或大幅度減少；這是用它和將原產品進行比較試驗、在相同的田塊里觀察差異，差異明顯是好肥料，差異不明顯，表明該產品有問題，建議放棄使用。

即選用減量置換準則，堅持總供給與總需求的根本平衡。要做到這一點，須鼓舞引導企業吞并重組，構成上下游一體的工業系統及橫向跨職業的肥化企業聯合，組成多工業結合的大型綜合性企業集團公司。經過煤—肥、氣—肥、電—肥聯婚，完成資源共享、優勢互補;經過商場化整合，完成企業多元化開展，推進產能向動力產地特別是具有動力優勢的棉糧產地會集，逐漸與煤炭、天然氣和電力完成一體化出產。

有機肥真假鑒別
1.泡水法
　　取一水杯，把有機肥樣品泡在水里，然后用手把泡在水里的有機肥碾碎，攪一下能直觀的看出有機肥的原料；再放置一段時間，如果有機肥與水短時間內分層的話說明有機肥比重大，含土較多。
　　2.聞味法
　　仔細聞一下肥的味道看是否有氨味，糞便味，淤泥味，好的有機肥應該是一種腐熟的味道。
　　3.手捻法
　　取有機肥用大拇指和食指來回碾壓，如果有硌手的感覺，則里面有沙?；蚱渌s質。
　　4.菌種測試法
　　取一水杯把有機肥放在里面，撒少許水（注意不要泡水，潮濕就行），放在溫暖適宜的地方，好的有機肥會抱團長出白色菌絲，掰開有機肥顆粒會看到里面也有白色菌絲。
　　5.盆栽測試法
　　取一盆花，抓把有機肥直接撒在花的根莖部，澆上水，好的有機肥會逐漸長出白色菌絲，促進植株生長，質量不合格的有機肥會熏苗，植株逐漸萎靡，直至。
　　6.對比試驗法
　　選擇好有機肥后在種植作物時，留出一部分不施用該有機肥，觀察植株的表現，好的有機肥在長勢、產量、品質上都會有明顯的效果。 [5]

取土化驗縣要根據不同土壤類型和作物布局，以糧食、蔬菜、果樹等作物為要點，做好取土化驗、肥效驗證實驗等基礎性作業，及時修正和完善區域上肥配方，加速測土配方上肥技能運用。增效縣還要樹立化肥減量增效演示區，發揮演示帶動效果，削減化肥運用，進步化肥利用率。