轉錄因子ChIP-seq整體服務
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轉錄因子ChIP-seq整體服務
發布時間:2017-09-13 09:40:24 | 瀏覽次數:
項目簡介
基因的轉錄調控是生物基因表達調控層次中關鍵的一層,而轉錄因子是參與基因表達調控的一類重要的細胞核蛋白質。轉錄因子通過特異性結合調控區域的DNA序列來調控基因轉錄過程,因此在全基因組水平將轉錄因子定位于靶基因DNA是認識轉錄調控網絡的有效方法之一。
通過轉錄因子ChIP-Seq技術能夠揭示轉錄因子的結合位點和確定直接的靶基因序列,可在體內分析特定啟動子的分子調控機制。ChIP-Seq已廣泛應用于研究一些經典轉錄因子和一些新的轉錄因子在全基因組上的結合情況,實現全基因組層面分析一些經典的轉錄因子的調控網絡,或為新轉錄因子的功能研究提供一些線索。
表觀生物技術團隊具備豐富的ChIP實驗經驗,利用經驗證的ChIP級抗體,提供轉錄因子共沉淀服務,并結合新一代高通量測序技術,為生物醫學研究人員提供轉錄因子研究整體服務(ChIP-seq)。
項目流程 :
樣本要求:
人及大鼠或小鼠細胞
細胞量達到107個
組織樣本需評估
測序模式:
SE50
測序數據量:
20M
生物信息分析內容
一、標準信息分析
1. 去接頭污染,去低質量reads和測序質量評估
2. ChIP測序序列與參考基因組序列的比對
3. ChIP測序reads在全基因組的分布
4. Peak鑒定及基因原件分析
5. Peak相關基因篩選與GO功能聚類分析、Pathway分析
二、信息分析
可根據客戶的需求,定制信息分析內容。
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